Қазалы темір жол ауруханасының хирургиялық бөлімшесі үш қабатты типтік аурухананың 2-ші қабатында орналасқан. Бөлімше 15 төсек-орынға есептелген. Бөлімшеде 5 орындық 4 палата, 3 орындық 1 палата, 2 орындық 2 палата, 1 орындық 3 палата, таза таңу бөлмесі, іріңді таңу бөлмесі, егу бөлмесі, асхана, клизма жасау бөлмелерінен тұрады. Операция жасау бөлімі, манипуляция бөлмесі, плазмаферез бөлмесі, стерилизация бөлімі бөлек қанатта орналасқан. Сол себепті қазіргі кездегі стандарттарға сай ота жасау мүмкіншілігі бар.
Операция жасау бөлімі үлкен және кіші зал, операция алды бөлмесі, дәрігерлер бөлмесі, мейіркештер бөлмесі, стерильді аспаптарды сақтау бөлмелерінен тұрады. Операциялық құралдардан: видеолапароскопиялық қондырғы, травматологиялық, жалпы хирургиялық, нейрохирургиялық жиынтықтармен толық жабдықталған.
Хирургия бөлімшесінің меңгерушісі бірінші санатты дәрігер-хирург Ахмедов Садуақас Абибуллаұлы, жұмыс өтілі – 29 жыл. Травматолог-ортопед дәрігер жоғары санатты Амангелді Қуантқанұлы Қанатов, жұмыс өтілі - 29 жыл.
Бөлімшеде 2012 жылдан бастап жоғары мамандандырылған травматологиялық-ортопедиялық көмек көрсетілуде. Осы аралықта жамбас буындарын ауыстыру, сынған сүйектерді интрамедуллярлық остеосинтездің қазіргі заманғы әдістерімен қалпына келтіру оталары жасалады. «С-дуга» құрылғысы 2016 жылы алынып, ота барысында кең қолданылуда. Лапароскопиялық қондырғы 2002 жылы алынып жұмыс істеуде. Лапароскопиялық оталардан холецистэктомия, асқазан ойық жарасын тігу, аппендэктомия оталары жасалуда.
Травматолог-ортопед дәрігер жоғары санатты Қанатов Амангелді Қуантқанұлы, жұмыс өтілі - 29 жыл.
Уролог дәрігер Жасанов Е.Е жедел және жоспарлы түскен урологиялық науқастарға көмек көрсетеді. Жұмыс өтілі - 17 жыл
2015 жылдан бастап 15 орындық нейроинсульт бөлімшесі ашылды. 2 дәрігер нейрохирургиядан дайындықтан өткен. Нейрохирургиялық жарық түсіргіштер, ота жасауға арналған микроскоп, видеолапароскопиялық орталыққа қосатын нейрохирургиялық жапсырма, электротрепан, доғалық рентгеноскоп аппараттары алынып, жылына 10-15 ке дейін трепанация жасалуда.
2020 жылы хирургиялық бөлімшеде күрделі жөндеу жұмысы жасалды. Барлық есік, терезелер пластикке ауыстырылды, палаталардың едендеріне паркет салынды.
Осы қабатта реанимация бөлімі 8 орындық болып жұмыс істеп тұр. Реанимация бөлімі 8 төсек орынға есептелген. Реанимация бөлімі орталықтандырылған оттегі орталығына қосылған. Барлық құрал-жабдықтармен: мониторлар, дефибриллятор, тыныс алдыру аппараттарымен және дәрі –дәрмектермен толық қамтамасыз етілген. 2021 жылы «Фабиус» атты операция кеізнде жасанды тыныстандыру аппараты алынды.